Самозанятые освобождены от уплаты НДФЛ, так как платят налог на профессиональный доход. Компаниям в этом случае при выплате по гражданско-правовым договорам удерживать НДФЛ не надо.

Такое разъяснение дано ФНС в августовском письме.
Организации, производящие выплаты по договорам ГПХ, обязаны удерживать и перечислять в бюджет НДФЛ. Исключения – ИП, самозанятые, адвокаты и другие, указанные в ст. 226 НК.

Так как эти категории людей самостоятельно перечисляют налоги с полученных доходов.
Самозанятые с доходов уплачивают НПД, а не НДФЛ. Значит, компании освобождаются от обязанностей налогового агента.

Источник: Клерк